图 1:稳定 假设的膜蛋白在合成纳米盘中的示意图。在图例中,是使用 SMA 作为稳定聚合物,但DIBMA也能起到这样的作用。
合成纳米盘是纳米盘领域的第二大选择。它们在某些关键点与 MSP纳米盘不同,但也存在某些相似之处。
合成纳米盘的制备
与MSP纳米盘的三种制备方式(点击查阅系列文章:什么是纳米盘Nanodisc?)相比,合成纳米盘只能直接从完整细胞中提取。在此过程中,使用的合成聚合物具备双重功能。首先,它溶解细胞膜,类似于去污剂。然后,使用天然细胞磷脂在膜蛋白周围形成纳米盘结构。这一过程可类比成曲奇成型刀,即通过冲压加工,将曲奇与面团分离。
尺寸
合成纳米盘的尺寸是可变的,决定合成纳米盘直径的主要因素是纳米盘包围和稳定的膜蛋白复合物的尺寸。因此,对于合成纳米盘,无法给出确定的尺寸。但是,合成纳米盘的尺寸范围包含在MSP纳米盘的尺寸范围之中(表 2)。这适用于迄今为止所有已确定的聚合物。若合成纳米盘复合物需要均匀的纳米盘尺寸,则必须采用如Rho1D4-tag等类似亲和层析法对稳定后的目标膜蛋白进行纯化,然后再采用排阻层析(SEC)法对纳米盘尺寸进行处理。
采用哪种聚合物?
有越来越多的聚合物可用于合成纳米盘。每种聚合物都有其自身的优缺点。例如,DIBMA可以吸收波长为280 nm的光,与蛋白质类似。同时,AASTY与其他聚合物相比,具有相当固定的纳米盘直径范围。
图2:DIBMA 与 SMA 看起来似乎可以互换,但实际上还是存在一些差异的。
选择膜支架蛋白(MSP)?
还是合成纳米盘?
那么,最后的问题仍然是哪种类型的纳米盘最适合您的项目?MSP 及合成纳米盘都旨在通过模拟细胞膜环境来实现膜蛋白的增溶和稳定。但是,如前所述,二者之间存在着一些关键性差异。表 1 列出了所有差异及其各自的优缺点。 表 1:MSP 与合成纳米之间的直接比较。